申請QS認證的主要手續如下：
1 有營業執照或者企業名稱預先核準通知書；
2 有與所生產產品相適應的專業技術人員和檢驗檢疫手段（可通過咨詢公司獲取幫助）；
3 有與所生產產品相適應的生產條件，如生產廠房的土地證——如沒有土地證需所在鄉鎮辦理證明建設用地的手續等（可通過咨詢公司進行建立和整改）；
4 有與所生產產品相適應的技術文件和工藝文件；
5 有健全有效的質量管理制度和責任制度；
6 產品符合有關國家標準、行業標準以及保障人體健康和人身、財產安全的要求；
7 符合國家產業政策的規定，不存在國家明令淘汰和禁止投資建設的落后工藝、高耗能、污染環境、浪費資源的情況;
8、法律、行政法規有其他規定的，還應當符合其規定。
9. 在本省質監局網站上下載《食品生產許可證申請書》以及所申報產品所屬單元的《審查細則》，如果不知如何下載或者不了解自己產品應該所屬的分類，請咨詢當地質監局。山東省內的企業可以向我咨詢。山東省質監局的申請書一般已經分好了申報單元，并且是EXCEL格式。
10.根據《審查細則》上的要求，針對自己的廠房、設備、文件資料是否齊全，產品是否有檢測報告等要求進行檢查、整改、完善。
11.填寫《食品生產許可證申請書》，上報質量技術監督局。
12.提交材料（QS食品企業生產許可證申請需要準備的材料）主要包括：（1）《食品生產許可證申請書》一式三份（2）營業執照復印件或者預先核準通知書復印件一式三份（3）換證企業還需提供原生產許可證復印件一式三份（4）組織機構代碼證（復印件）一式三份；不需辦理代碼證書的，提供企業負責人身份證復印件一式三份（5）生產場所布局圖一式三份（6）工藝流程圖（標注有關鍵設備和參數）（7）企業質量管理文件一式三份（8）產品標準。如果產品沒有國家標準，需向質量技術監督部門進行企業標準備案一式三份（9）申請表中規定應當提供的其他資料。
13.需要特別注意的是，《食品生產許可證申請書》封面應當加蓋企業公章，復印的印章無效。
14.質監局收到申請材料后，經審驗，材料符合受理標準，通知企業《行政許可申請受理決定書》；申請費用2200（同時申請兩個含兩個以上的每加一個加440元，但會大大增加申請通過的難度）
15.質量技術監督局指派2至4名審查員組成審查組，對企業進行實地核查，審核時間為企業應當予以配合。（一般提前五日通知企業）
16.現場審核不合格，企業應迅速整改，兩個月后方可重新申請。如審核合格進入下一步。
17.封存樣品，7日內由企業交付檢驗機構，完成檢驗后出具檢驗報告。（費用因產品種類不同不盡相同，國家收費標準）
18.根據審核提出的整改項進行整改，并對申報材料進行進一步的修改完善。
19.質監局對申報材料進行匯總，審核，申報企業等待發證。